Ekstrakurikuler merupakan sarana pengembangan bakat dan minat siswa untuk mencapai prestasi. di MAN 1 Konawe Selatan terdapat begitu banyak kegiatan ekstrakurikuler yang dibuka sesuai kemampuan, minat dan bakat siswa. Adapun ekstrakurikuler tersebuat antara lain:
A. SAINSTEK
- Kimia
- Fisika
- Biologi
- Matematika
- Ekonomi
- Geografi
- TIK
- Karya Ilmiah Remaja
- Fotografi, Jurnalistik, Sastra dan Perfilman
B. BELA NEGARA
- UKS
- PMR
- PASLAH
- Pramuka
- PIK – Remaja
C. OLAH RAGA
- Sepak Bola
- Bola Volly
- Sepak Takraw
- Tenis Meja
- Bulu Tangkis
- Futsal
D. SENI
- Tahfiz Al-Qur’an/Tilawah
- Majelis Ta’lim
- Baca Tulis Alqur’an
- Tartil Al-Qur’an
- Pidato Bahasa Arab
- Pidato Bahasa Inggris
- Qasidah
- Tari
- Kaligrafi
